引起胃憩室发病的原因，主要是有以下两点：
第一，先天性胃憩室。先天性胃憩室主要由于患处部位纵隔肌肉比较薄弱导致，一般是位于胃后壁贲门的附近，主要是在胃小弯侧的食管和胃连接处下方的2~3cm内。通常并不会伴随出现溃疡、肉芽肿或者是肿瘤，属于真性憩室。
第二，继发性胃憩室。继发性胃憩室既存在真性憩室，又存在假性憩室。主要是由于胃溃疡、肉芽肿以及肿瘤手术等因素，而引起胃内压力增加。由于幽门梗阻，而导致压力增大形成的憩室，称之为内压性憩室。