真菌感染和细菌感染的区别有很多，主要区别如下：
1.致病菌不同。引起细菌感染常见的病原菌是金黄色葡萄球菌、链球菌等；真菌感染的致病菌有念珠菌、毛癣菌等。
2.引起的疾病不同。细菌感染通常可以引起毛囊炎、疖痈、丹毒等；真菌感染主要以癣为主，比如手足癣、头癣、体癣。
3.临床表现不同。细菌感染以局部红、肿、热、痛为主，有时还会伴随着高热的症状；真菌感染可以引起红斑、丘疹、脱皮、皮肤瘙痒的症状。
4.用药不同。细菌感染使用抗生素治疗，比如头孢、青霉素；真菌感染需要用抗真菌药物，如特比萘芬、伊曲康唑。