扁平疣是有可能会自己消失的，但是这种情况是依据每一个人的身体状态和生活习惯来决定的。
如果有扁平疣的患者免疫力比较强，日常生活中作息比较规律，然后没有频繁地喝酒、没有频繁地搔抓，这种扁平疣可以逐渐自己消失，但是消退的时间可能较长，需要几个月甚至几年的时间。
如果有扁平疣的患者免疫力比较弱，日常生活中作息不规律或者频繁饮酒、熬夜、精神压力大。这种情况扁平疣自己消失的概率就比较小了。而且这种情况还有可能会导致扁平疣症状加重，引发皮损增多，甚至会出现轻度的瘙痒现象。
所以当出现扁平疣时，最好是尽快治疗，不要等待自己消退。