醋泡花椒并不能够治疗灰指甲。
花椒本身属于一种调味类的食品，也属于一种中药，用花椒煮水用来浸泡手部或者皮肤表面，确实可以起到杀虫和止痒的作用。用醋来进行浸泡，可以抑制真菌的代谢和繁殖，对于手癣和足癣可能会有一定的改善，但是这种方式对于灰指甲效果并不好。
灰指甲也叫做甲真菌病，是因为指甲甲板下方滋生了一些真菌，真菌在代谢和繁殖的过程中破坏了指甲的结构，从而引发了这种疾病。
选择使用这些外用的药物，无法直接接触真菌被感染的部位，从而没有办法达到理想的治疗效果，建议还是选择口服的特比萘芬片来进行治疗。