动脉血栓的治疗方法与很多因素有关。发病的急缓、发病的部位、动脉血栓的形成以及来源等，都影响治疗方法的选择。
如果是由于动脉粥样硬化等病变引起的急性动脉血栓形成，比如急性心梗、急性脑梗等，可以采取溶栓的方法治疗，也可以考虑支架的方式治疗，心梗还可以根据病情选择搭桥的方式治疗。
如果是其他部位的栓子脱落后进入到动脉血管，造成了动脉栓塞，可以选择动脉取栓术治疗。这样可以快速缓解动脉栓塞的状况，可以快速改善动脉血管远端的血液供应。