肛乳头炎可以调整饮食结构，配合温水或中药坐浴、外用痔疮药膏对症治疗，必要时可行手术将肛乳头切除。肛乳头存在于肛隐窝口，环绕着肛门生长，大约有十几个。肛乳头的体积非常小，肉眼难以看到。
当出现慢性的肛窦炎或者长期腹泻刺激时，会引起肛乳头出现炎症，患者会有肛门的烧灼痛。此时可以保持大便通畅，外用痔疮药膏消肿、止痛及保护创面治疗，多数患者的症状可好转。
部分肛乳头炎病程长可逐渐引起肛乳头肥大，甚至肛乳头瘤，此时需要进行手术将肥大的肛乳头切除。