黄连上清丸主要由黄连、栀子、连翘、蔓荆子、防风、芥穗、白芷、黄芩、菊花、薄荷。大黄、黄柏、桔梗、川芎、石膏、甘草和旋覆花组成。黄连上清丸具有清热通便、散风止痛的作用。主要用于热邪炽盛所致的头晕、脑胀、牙龈肿痛口舌生疮、咽喉红肿、耳痛、耳鸣和大便干燥、小便黄赤。
黄连上清丸多为清热泻火解毒之药组成，具有非常良好的清热解毒作用，适合用于火热炽盛的病症。火邪在上就可以见到头目耳窍齿舌均会受到影响，在下就会影响到大小便。因为黄连上清丸主要是针对实热证的药剂，所以它的清热力度比较大，像孕妇脾胃虚寒的人群是不适合服用的，现在也多用于治疗偏头痛、口腔炎、扁桃体炎等中医辨证属于火热炽盛的疾病。