手足口病和口腔溃疡最明显的区别为患病病因的不同。
手足口病属于一种传染性较强的肠胃道病毒感染性疾病，患儿一旦出现免疫能力降低的情况就容易感染相关的肠道病毒，从而引发自身多处出现疱疹的不良患病症状。其中，最主要的患病部位就包括有口腔内部、手部，以及其他部位等。
而口腔溃疡则属于较轻微的口腔疾病。口腔溃疡患儿最主要的患病病因一般是自身缺乏相关维生素，且病变部位仅限于口腔内。对于此类患儿，患儿只需要采取补充所缺乏维生素，就能达到较好地改善不良症状的治疗效果。