卵巢巧克力囊肿属于一种子宫内膜异位症，异位在卵巢深部的子宫内膜，其结构与正常位置的子宫内膜相同，会出现增生或分泌起的改变，像月经一样经血无法排出，积聚在卵巢形成囊肿。积血多呈巧克力状。常因表面出血或囊壁破损与邻近的器官粘连。病人会有月经紊乱、痛经、不孕等表现。而卵巢囊肿，大多为卵巢的单纯性囊肿，如滤泡囊肿或黄体囊肿，单侧多见，囊壁薄，囊肿与周围没有黏连，囊肿可能随着周期而变化。卵巢的单纯性囊肿，患者大多没有明显的症状。当肿物明显增大的时候，可能有腹部增大，当扭转的时候，可能有蒂扭转或破裂。