残留的牙根可以根据具体情况进行处理。
如果牙根长度处于正常范围，与周围牙槽骨紧密结合没有发生根管内吸收，可以摘除残留的牙髓组织，彻底消毒后严密充填管腔，制作桩冠修复。
如果牙根颈部边缘产生龋损，可以去净腐质保留健康的牙体组织，进行牙根牵引手术，粘固桩核与邻牙一起制作连冠修复。
如果磨牙的髓室底形成小于0.5cm的穿孔，可以应用MTA修补后保留牙根，制作覆盖义齿修复。
如果牙根较短，明显松动或牙槽窝内有炎性分泌物形成，则预后一般较差，可以拔除后进行种植或采取其他方式的修复。