宝宝发烧灌肠一般来讲是没有副作用的，但一定要操作技术娴熟，又有适应症才可采用。
因此具体是否有副作用，还需要根据孩子病情来判定，如果体质较差的宝宝会出现腹部不适、腹泻或食欲下降等，如果情况较为严重的宝宝还可能损伤直肠黏膜，并且引起大便失禁的情况。
在日常生活中宝宝出现发热的情况，主要见于炎症引起的，这时候应该去当地医院进行血常规检查，根据检测结果，然后再进行治疗。如果是因为细菌感染而引起的发烧，就应该按照医生嘱咐使用头孢类消炎药物进行治疗，但如果是病毒性感冒而引起的发烧，就应该选用抗病毒药物进行改善。