胆结石确诊首先应该做B超检查，B超最广泛应用于胆结石的检查，其特异性和敏感性均是比较高的。超声下结石表现为高振幅回声以及声后阴影，超声检查如果不能发现结石，并不能排除胆结石的诊断。一般来讲超声检查能发现95%以上的结石，和超声检查相比，CT可以进行补充性的检查，对于一些超声没有发现的结石，可以通过CT检查，进一步明确诊断，此外CT还可以显示胆管的扩张结石以及肿块儿。
另外如果高度怀疑肿瘤造成的胆总管梗阻，还可以进行CT检查，此外胆管造影，尤其是磁共振胆管造影也经常应用于胆结石中的诊断，其诊断比超声更加敏感以及特异性更好，只是价格更贵一些。磁共振就是MRCP检查，是非侵入性的检查，避免了ERCP以及PCT带来的风险。