1.首先肛隐窝炎与痔疮是两种不同的疾病。肛隐窝炎是一种肛周感染性疾病，是以渗出、肛门坠涨为主的局灶性炎症。而痔疮的发生是由于肛垫的病理性肥大、移位及肛周皮下血管丛血流淤滞而导致。
2.临床表现不一样：肛隐窝炎急性期主要表现为肛管内灼热刺痛、撕裂、痛肛门坠胀感。如果肛门括约肌受到刺激，还可以表现为短时间阵发性钝痛或者疼痛持续数小时。严重时还可以导致臀部、骶尾部及会阴部的放射痛。而痔疮主要表现为无痛性便血和肿物脱出。