因为引起肠梗阻的病因很多，所以它的手术后遗症也不尽相同。比如胃肠道恶性肿瘤引起的肠梗阻，手术后遗症包括癌症复发、胃肠道出血、肠梗阻复发，患者出现消化吸收不良的情况，贫血、恶心、呕吐等等。
而且肠梗阻的病变严重程度不同，引起的手术后遗症也是不同的。比如肠扭转引起的肠梗阻，病情发现较晚没有及时治疗，有可能会导致肠坏死。
手术需要将坏死的肠管切除，再进行断端吻合，手术后遗症包括吻合口溃疡或出血、肠梗阻复发等。