全飞秒和半飞秒都属于激光手术，只是两者手术过程存在一些差异。
首先针对于全飞秒手术，其手术中不用切削角膜上做出一个典型的角膜瓣，所以在术后角膜的表面的创口极小，且没有环状创口，因此全飞秒手术的优点在于术后不会出现严重的干眼症，适用术前干眼严重的患者。但其劣势在于不适合角膜厚度较薄、度数高的患者。所以如果角膜薄，近视度数高的患者进行全飞秒手术，术后可能更容易出现并发症，从而导致术后效果比半飞秒差。
而半飞秒在术中是需要切削除一个角膜瓣，所以会在角膜上遗留一个环状的微创切口，所以一般半飞秒手术术后干眼症状会比较明显。但半飞秒手术的优点在于，其术后视力一般恢复较快，大多数患者可能术后1-2天视力可以提高到1.0，且半飞秒手术比较适合度数高的患者。所以两种手术方式都各有其优缺点，具体手术方式的选择需要根据做个体化的设计。