吞口水咽喉有点痛，首先考虑可能是因为咽喉部急性炎症引起的，例如急性会厌炎、急性咽喉炎、急性扁桃体炎等，都容易会导致咽喉部位黏膜呈现充血、水肿的状态，一般会伴随着疼痛。当炎症感染严重时，甚至可能会出现呼吸困难症状。
其次，有可能是因为咽喉部黏膜病变引起的，例如咽喉部黏膜溃疡，在吞口水时也会感觉到咽喉有点痛。
另外，也不排除可能是其他疾病造成的，例如咽喉部神经痛，吞咽时尤其是吞咽酸性物质时，会对咽喉部黏膜造成刺激，导致神经反射性疼痛。