扁桃体炎对核酸检测是没有影响的。一般情况下扁桃体炎是病毒或细菌感染导致的发炎症状，而核酸检测是通过提取鼻黏膜或咽喉黏膜的分泌物作为样本进行检测有无感染的病毒核酸，两者之间并无联系，也没有任何的影响。
因此即使是患有扁桃体炎也不会影响到核酸检测，有时候核酸检测往往会出现假阳性和假阴性的现象，对于这一现象应多次提取样本检测，如果每次检测结果都一致的话，可以确诊感染的病毒。
对于接受检测的人来说，不用太过焦虑，耐心等待检测结果，根据检测的结果接受系统治疗即可。