甲亢和甲减相比较甲亢的危害更大：
第一点，甲亢可以引起多个系统的症状，严重的时候可以引起甲亢性心脏病，患者可以出现心律失常、心脏的扩大甚至发生心衰，发生甲亢心时，患者有猝死的可能性。甲减的患者虽然也会侵犯到多的系统，但是这些症状都是慢性的，较少发生急性的危害。
第二点，甲亢和甲减都可以发生临床危象，但是发生甲亢危象的频率可能更高，危害也更大。因为甲亢的患者在感染、创伤、手术这些应激情况下，都有可能会诱发甲亢危象，而甲减危象仅仅是发生在老年患者、久病没有治疗的人群中。
所以，临床上有些甲亢患者，宁愿治疗成甲减长期服药，比如使用放射性碘治疗或者是甲状腺手术治疗的甲亢患者。