咳嗽变异性哮喘的病因非常复杂，在临床上尚未明确，多考虑与过敏、身体免疫力情况、内分泌、精神状态以及遗传因素有一定的关系。
大部分的患者主要是受到过敏因素的刺激引起的，比如接触粉尘、尘螨、动物毛发、刺激性气体时容易引发或加重咳嗽变异性哮喘。除此之外还有一部分患者，食用某种特定的食物，比如螃蟹、大虾等海产品时，也会诱发病情。
当季节转换，天气骤变时受到冷空气刺激，或者受到某些药物、细菌、病毒的感染，也容易引起咳嗽变异性哮喘。咳嗽变异性哮喘，可以通过支气管舒张和激发试验来帮助诊断。