再有真菌性角膜炎的时候。会出现局部疼痛、畏光、流泪这些表现。这种疾病起病相对比较缓慢。在早期的时候会出现在有义务感的感觉。随后就会出现眼部刺激的症状。在角膜病灶局部呈灰白色，而且欠光泽。在外观看是比较干燥和粗糙的。
角膜表面会有隆起的症状。在溃疡的周围可出现浅沟，或者是因真菌抗原体反应而形成的免疫环，有时候可以见伪足或者是卫星灶。
角膜后可出现斑块的沉着或者是前房积脓。真菌进入前方可导致真菌性眼内炎。