肺癌微创手术相比开胸手术危险降低，但仍存在很多的手术风险：
1.出血。是最常见的微创手术风险，尤其是当患者肿瘤与正常组织分解不清时极易误伤血管，从而导致大出血的发生。
2.感染。主要包括伤口感染和胸腔内感染两类，但是微创手术相比传统手术感染的几率较低。
3.肿瘤播散。主要见于医源性播散，术中切除肿瘤过程中无法完整切除导致肿瘤种植转移的发生。
4.肺萎陷不良、低肺综合征、持续性的肺漏气等。
5.高碳酸血症。手术需要注入低流量的CO2，若手术时间过长，CO2流量较大，从而导致CO2进入血液，继发高碳酸血症。