风湿性关节炎和类风湿性关节炎的主要发病机理是不同的。
风湿性关节炎作为一种感染性疾病，虽然属于风湿系统疾病，但是与溶血性链球菌感染有关。风湿性关节炎主要侵犯肢体的一些比较大的关节，例如髋关节、腕关节、肩关节、踝关节等，而且会有明显的游走性疼痛现象。在治疗上主要是抗炎、抗风湿治疗。
类风湿性关节炎作为一种自身免疫系统疾病，发病的原因与遗传因素有关，也与自身免疫力低下有关。类风湿性关节炎主要侵犯肢体的一些小关节，例如掌指关节、脚趾关节等，而且早期会有明显的晨僵现象。治疗类风湿性关节炎主要是给予抗炎止痛、糖皮质激素，以及免疫抑制剂治疗。