化脓性骨髓炎的治疗，分为急性骨髓炎的治疗和慢性骨髓炎的治疗：
第一，急性骨髓炎其治疗，在早期需要进行全身支持疗法进行治疗，如进行补液、降温、纠正电解质平衡等，同时给予大剂量的敏感抗生素应用等进行治疗，还需要对肢体进行适当的固定制动，防止畸形和病理性骨折。如症状仍不能控制的必要时需要进行开窗引流等进行治疗。
慢性骨髓炎的治疗，除采用一些敏感的抗生素应用治疗外，一般需要采取手术治疗，需要进行死骨的摘除，同时进行窦道周围炎性组织的彻底清创等。