解脲支原体阳性的治疗时间需要两周左右，可给予红霉素或阿奇霉素等大环内酯类敏感抗生素治疗。
由于解脲支原体阳性感染，同时伴随尿不尽、尿道瘙痒等不适症状，抗炎药物服用的同时还需要服用吲哚美辛、氯苯那敏等对症药物。药物治疗期间可通过增加饮水量，忌口辣椒、饮酒等刺激食物，有助于症状改善。
由于支原体容易通过性行为以及被污染的内衣裤传染，为了避免再次被感染，需要做好性保护，性过程中全程戴套、阻隔保护。被污染的内衣裤需要高温煮烫处理。