男性有时小便时有刺痛，应该到医院做相应的检查，确诊是什么原因再进行治疗。
首先应该做尿常规检查看是否有尿路感染存在。如果确定是尿路感染，建议吃广谱抗生素，最常见的就是环丙沙星、左氧氟沙星等。如果疼痛比较剧烈，可以在肛门内给予止痛的栓剂，也可以吃碳酸氢钠有碱化尿液的作用，缓解排尿刺痛。也可以进一步做尿道镜，观察尿道内是否有结石。尿道有结石，会有突发性的排尿刺痛，同时会有血尿发生，尿道内有明显的异物感。
另外，尿道镜也可以进一步排除是否有尿道肿瘤存在。如果确诊有尿道肿瘤，需要早期进行手术治疗。尿道镜发现结石，可以行钬激光碎石。