小儿支原体感染其潜伏周期会比较长，主要表现为咽炎、鼻炎、气管炎和毛细支气管炎等疾病，主要症状有疲倦感明显、食欲不振。
咳嗽的初期主要表现为干咳，然后转化为顽固性的剧烈咳嗽，无痰或者伴有少量的黏液。这种咳嗽会在夜间加重，婴幼儿会表现为喘憋或者呼吸困难。对于一些感染比较严重的患儿，还会出现支原体肺炎。
肺炎支原体感染容易引起呼吸道以外的其他器官出现病变，比如心肌炎、肝炎、肾炎、溶血性贫血等。因此，对于支原体感染要引起重视，积极地诊断和治疗。