染色体多态性指的是在正常人群中，可见到的同源染色体形态或着色方面的变异。这种变异不会导致生物功能异常，不会引起疾病或者异常情况，不产生遗传物质的增加、减少或功能异常。
染色体多态性是染色体的微小变异，属于正常变异，不引起表型异常，不具有临床意义。只是比正常的染色体多了一点或少了一点。
从分子水平上看，结构异染色质不等于含结构基因，没有转录活性，往往并不对个体的表型产生直接影响。染色体的个体表型和智力都是正常，染色体多态性具有一定的遗传性。