偏头痛患者可于神经内科就诊，也可于疼痛科进行相关诊断治疗。
偏头痛的病理机制虽然尚未明晰，但神经学说的影响较大，即主张此类患者病情的发作与否和神经功能存在较为密切的关系，同时研究亦表明罹患偏头痛的患者存在神经功能紊乱的情况，而此类患者可能于神经内科就诊。
同时，偏头痛患者发作时，疼痛剧烈，常呈现中度疼痛及以上的痛感，同时对于偏头痛的诊疗多进行止痛等干预。故而，此类患者亦可于疼痛科进行相关诊断治疗，选择对乙酰氨基酚等药物进行止痛处理，同时可以考虑行选择性神经阻滞治疗，以达到缓解疼痛的目的。