长期便秘治疗起来比较困难，尤其是在结肠发生了病变后，几乎是不能治好的。导致便秘的原因有很多，最常见的就是肠蠕动减慢，还有就是由于先天性巨结肠导致的。
肠蠕动减慢常见于年轻的女性，这类患者因为工作需要，长时间不活动，就会容易导致肠蠕动减慢。粪便在肠管内停留的时间过长，粪便内的水分被大量吸收，导致粪便干结质硬，排出困难，所以便秘治疗起来就比较容易，只要增加活动量促进肠蠕动，可有效改善便秘。
还有一种情况是先天性的巨结肠，一种先天性疾病，结肠管径增粗，而且蠕动差，粪便大量堆积在结肠内不能排出，从而便秘，要想治疗这种便秘，必须进行手术，术后效果也不是很满意。
老年人经常发生便秘，从中医方面是由于气血亏虚、津液不足导致的，这种便秘是顽固性的，治疗起来很困难。有的老人常年服用泻药，结肠都发生了黑变，对泻药产生了依赖，停药后便秘会更加严重。