生理期同房可能会诱发月经不调。因为生理期时宫颈通常处于开放状态，在性生活的过程中，有可能使一些细菌进入宫腔内，容易使宫腔内出现感染。
感染加重后会对子宫造成严重损伤，就会影响月经周期诱发月经不调。当宫腔内存在感染后，会出现腹痛以及经血变臭的现象。
此外，由于输卵管与宫腔相连，感染加重后可能会影响输卵管导致排卵异常，这会对女性的生育能力造成一定的影响，甚至会引起不孕，因此禁止在生理期间进行性生活。