附睾炎一般不能自愈，只有使用抗菌药物治疗，才能够控制病情，防止附睾炎进一步加重。
如果长期不进行治疗，有可能会使局部出现脓肿或者纤维化，甚至会对男性的生育能力造成影响。因此，在确诊为附睾炎以后，一定要及时进行治疗，应当使用敏感的抗生素类药物治疗，比如头孢菌素类或者青霉素类的抗生素。也可以对附睾部位进行热敷，能够使血液循环增快，促进炎性物质消退。
在治疗过程中，也要加强护理，避免性生活，多休息，避免剧烈运动，清淡饮食。