肠瘘的检查及诊断，需要依赖于专科医生的常规查体、腹部CT、血常规以及电解质等辅助检查。
当肠瘘发生后，肠腔的内容物会溢出到腹腔，引起腹膜刺激征及腹腔感染。通常上消化道肠瘘可引起剧烈的腹痛，但腹腔感染通常不是特别严重。下消化道内容物是粪便，因此引起的腹膜刺激征不强烈，但可引起严重的腹腔感染。
因此，肠瘘诊断需要普外科或肛肠外科医生查体，配合腹部CT、血常规以及电解质等检查，明确诊断。