胃真菌病的发病率还是比较低的，目前发病率是呈现上升的趋势，它的发生是有一定条件的。在正常人的口腔和肠道都有真菌的寄生，在正常情况下是不发病的。
只有在一定条件下，真菌才会诱发深部的真菌病。这些诱因包括当长期大量应用抗生素、肾上腺皮质激素、免疫抑制剂、抗肿瘤药物等，引起了黏膜的损伤、炎症，出现长期的胃溃疡病史，或是原有溃疡病加重、腹痛等症状。
治疗主要是抗真菌。治疗开始前需要检查肝肾功能、血尿常规、c反应蛋白、CT扫描、心电图等。还要治疗引起真菌感染的一些原因。