小檗碱是黄连素。
其主要成分为盐酸小檗碱，这种成分可从中药黄连中提取得到，也可从三颗针、黄柏等植物中提取，是一种黄色针状结晶的季铵生物碱，味道很苦，有抑菌作用，对痢疾杆菌、大肠杆菌所致的肠道感染治疗有不错的效果。
不过服用这种药物的患者需要注意在用药期间不要喝茶，因为茶水中有鞣质成分，易使本药物成分中的生物碱沉淀，形成较难溶解的鞣酸盐沉淀，会降低药效，从而可使疗效降低。另外，有溶血性贫血的患者以及葡萄糖-6-磷酸脱氢酶缺乏症患者应禁用本品。