肛裂的临床表现为疼痛、便血以及便秘。
其中疼痛是最主要症状，表现为一个周期性：疼痛－缓解－高峰－缓解－再疼痛，其中以排便时疼痛最重，便后数分钟疼痛明显缓解，之后内括约肌痉挛，持续数分钟或数小时，坐立不安、难以承受，直至肌肉松弛，疼痛逐渐缓解，待到再次大便，疼痛再次发生。
便血以排便时滴血或擦纸上沾血为主，鲜红色，患者在患肛裂后因肛门疼痛恐惧排便，久而久之引起粪便更为干硬，便秘又可使肛裂加重，如此往复形成恶性循环，长期出血有可能导致贫血，反复肛裂撕开有可能导致肛周脓肿。