腰两边疼的原因多由于两侧肌肉劳损或损伤引起的，如胸腰筋膜及竖脊肌受累最为多见。
当肌肉软组织受到牵拉、损害后会诱发损伤，也容易引起肌筋膜炎造成腰部两侧疼痛，限制腰部的正常功能。
腰部两侧肌肉和韧带对腰椎的稳定起到重要作用。如果不能及时改善缓解症状，还可能会造成腰椎进一步损伤，诱发椎突或滑脱等问题。
腰部两侧还是内脏肾区，如果患有一些慢性肾病，如结石、肾炎等，也会造成腰部两侧疼痛，可以就诊泌尿外科检查。