肛门瘙痒如果是由于细菌、病毒等因素感染所引起的，并且出现了分泌物的存留，并且发生了组织溃烂的情况下，是可以使用碘伏涂擦的。主要就是起到杀菌、抑菌的作用。
如果单纯肛门瘙痒发生是由过敏等因素所导致的，或者是由于痔疮、肛瘘等因素所引起的，一般不建议使用碘伏进行局部涂擦。频繁地使用碘伏涂擦可能会导致局部菌群的失调，有可能加重肛门瘙痒的症状。
肛门瘙痒发生以后，还是建议患者先到正规医疗机构的肛肠科进行就诊。在诊断明确以后，通过药物进行对症的治疗。如果是由于痔疮等因素引起的，药物治疗效果不理想的，可以通过手术治疗。