月经干净后3天同房是否安全是不确定的，跟女性月经期及月经周期长短有一定关系。月经周期28~30天，经期5~7天的女性，月经干净3天同房一般是比较安全，因为月经的前7天和后8天是安全期。
但是，安全期也不是绝对安全，如果由于精神压力大，或者药物影响可能会导致异常排卵。而且如果月经期比较长，月经周期比较短的女性，月经干净3天可能已经进入排卵期，这种情况下同房可能会导致女性怀孕。
建议如果想要避孕不能采用安全期避孕的方法避孕，避免导致意外怀孕，可以采用避孕套或者短效避孕药的方式进行避孕比较好。