引起房颤的心脏病常见的有高血压心脏病、风湿性心脏病、二尖瓣狭窄、冠心病、肺心病以及预激综合征等。其它系统的疾病，如甲亢等，也可以引起心房颤动的发生。此外，运动、过量饮酒，也会引起房颤的发生，有些房颤的发生跟年龄增大有关，还有些房颤发生的原因不明确。
心脏病基础上发生的房颤，可以进一步加重心脏病的病情。因此，除了积极的治疗基础心脏病以外，还要积极的控制心房颤动，可以采用复律或者控制心室率的方法进行控制。
由于房颤会引起左心房附壁血栓，脱落后可以导致脑栓塞的发生，对于栓塞发病风险高的房颤患者，需要长期给予抗凝治疗。