治疗霉菌性阴道炎的口服用药一般有氟康唑、伊曲康唑、制霉菌素片等等，这些药物对肝功能会有一定的影响，服药期间要定期化验肝功，口服用药适合于没有发生过性生活的女性采取。
另外，对于复杂性霉菌性阴道炎，可以与阴道局部用药配合使用，可以放置阴道的药物有克霉唑、制霉菌素栓、硝酸咪康唑、益康唑栓等等，这些都是治疗霉菌性阴道炎的常用药物。
药物一定要在医生的指导下使用，用药期间避免同房，以免交叉感染，同时要注意外阴清洁卫生。用药的时间长短要根据病情的严重程度，用药以后要注意复查，当霉菌完全转阴才能停药。