幼儿经常腹泻可能是生理因素、肠道感染、非感染性因素等原因引起。
生理因素往往是孩子的消化道、消化腺发育尚未健全，比如消化酶会影响食物的消化吸收，从而导致出现腹泻。中枢神经发育不完善也会刺激直肠，引起敏感度增加，造成排便次数增多。肠道感染通常见于病毒感染、细菌感染、寄生虫感染，由于致病菌释放出大量的毒素，对肠道黏膜造成刺激，从而引起大便次数增多。
非感染性的因素包括由于腹部受凉、经常吃过冷的食物或者滥用抗生素，也会造成腹泻的现象发生。