部分鼻咽癌患者可以选择靶向药物进行治疗。
但是鼻咽癌的靶向治疗，主要适用于晚期鼻咽癌治疗。对于晚期鼻咽癌可以考虑在治疗前检测基因，当检测存在EGFR基因突变的时候，可以考虑采用尼妥珠单抗，与全身化疗联合抗肿瘤的治疗策略。靶向药物可以增强化疗药物的抗癌治疗效果，使部分患者能够从联合治疗中获益，以此延长生存时间。
临床上证实对鼻咽癌有效的靶向药物，主要包括尼妥珠单抗、贝伐珠单抗等，多与化疗联合使用。其他的一些小分子激酶类靶向药物，目前尚处于研究阶段尚未应用于临床。