脚上起小水疱可能是以下因素所导致：
1.如果与脚气患者共用了鞋袜或者浴盆，有可能被传染上脚气，就会导致脚上起小水疱，通常处于脚趾缝中间，一般还伴有瘙痒的症状。在确诊以后，应当使用抗真菌的药物进行治疗，并且做好防传染措施。
2.脚上起水疱还可能是湿疹所引起，通常出现于脚心部位，可能还伴有瘙痒、红斑、流水等症状。
3.如果穿的鞋子过紧，并且走路和站立的时间过久，会对局部造成挤压，也会导致局部出现小水疱，一般不需要特殊治疗，可能会自行消失。