双侧的上颌窦炎通常是无法自愈。
因为引发双侧上颌窦炎的原因，通常是由于细菌或病毒的感染、牙源性的疾病以及真菌感染所造成。疾病发病后，如果长时间不积极治疗，反而有可能引发慢性上颌窦炎的情况出现，甚至造成其它鼻窦腔以及临近器官的炎症感染性疾病。
因此，双侧的上颌窦炎，应当尽快确定病因，使用抗病毒药物、抗生素类的药物，或者是抗真菌类药物来进行规范化的治疗。具有牙源性感染的情况，还应当对病变的牙齿进行治疗，疾病才有可能痊愈，预后较好。