并殖吸虫病的诊断流程主要有以下几点：
1.要根据患者有生饮溪水史、有无生食过含有并殖吸虫的溪蟹，以及有无食用过作为最终宿主的果子狸、野猪、猴子等。
2.根据患者的临床症状判断，主要有肝脏的损害，如大多数的患者会出现肝区疼痛。早期的肝组织病变为带状出血坏死以及片状坏死，随后会演变成嗜酸性脓肿，脓肿的中心处为大量坏死组织、嗜酸性粒细胞，以及夏科-莱登晶体。还会有肝脾肿大、腹胀、游走性皮下结节、咳嗽、痰中带血、恶心、呕吐、腹泻等症状。如果幼虫侵犯到了脑部，还会出现癫痫、头痛、脑膜刺激征、视力下降等症状。
3.进行胸部X射线检查，可发现炎症浸润性阴影，血常规中可见嗜酸性粒细胞升高、血沉增快等。