生殖器疱疹目前没有办法做到真正意义上的根治，可以通过用药使症状暂时性的消退，但是一旦患者有免疫力减退或者短时间内过度劳累等情况，有可能会使生殖器疱疹再次在原发部位复发。
如果生殖器疱疹复发的比较频繁，比如每个月发作一次或者是半年内发作超过六次，可以考虑连续口服三到六个月的抗病毒药物，将病毒的数量控制到最低的状态。
同时加强自身免疫力，比如口服提高免疫力的药物或者是多运动，增强身体的抵抗力，这样就可以大大降低复发的几率。