泌尿系结石在不同的位置，引起的临床表现也有一定的区别。
如果是肾脏结石，会引起明显的肾绞痛，通常还伴有大汗淋漓、面色苍白，疼痛的时间可能为几分钟或者是几个小时，并且在排尿时还可能会出现明显的血尿。
如果是输尿管结石，会导致单侧的腰部出现疼痛，疼痛可放射至睾丸或者下腹部，通常还伴有恶心、呕吐、呼吸急促等症状。
如果是尿道中存在结石，一般会引起排尿困难、尿滴沥等症状。在严重时还可导致尿潴留，在排尿时疼痛会比较明显，疼痛可放射至龟头。