阴道超声能够检查出的妇科疾病大多数是一些器质性疾病。妇科常见的疾病子宫肌瘤是可以通过阴道超声检测出来，包括可以检测出子宫肌瘤的大小、位置以及是否发生变性。子宫腺肌症也是阴道超声能够检查出的疾病。
另外，输卵管和卵巢的疾病也可以通过阴道超声来发现。常见的有卵巢囊肿，其中可以检测出是单纯囊肿，还是卵巢的子宫内膜异位囊肿或者是炎性囊肿。卵巢生殖细胞肿瘤包括畸胎瘤等，也是通过阴道超声大多数都能够及时发现。
另外，一些恶性病变，包括宫颈癌、卵巢癌、输卵管癌等。如果已经有肿瘤的发展了，也可以通过阴道超声及时发现。