甲状腺功能减退如果不及时治疗，会导致其它的疾病。甲减的根本原因是甲状腺分泌甲状腺激素不足导致的，而甲状腺激素是促进人体新陈代谢的一个非常重要的激素。甲减后是否引发其它疾病，取决于甲减发生的年龄和甲减持续的时间。
如果甲减发生在幼年、儿童时期，由于这个时期是人体生长发育最重要的时期，此时甲减如果不能及时发现和治疗，可以导致呆小病。呆小病患者的体格发育和智力发育都会受到严重影响。
成年时期出现甲状腺功能减退如果时间比较短，及时发现治疗，可以仅仅表现为甲减症状，但如果甲减时间比较长，则会导致粘液性水肿、胃肠功能障碍等多种情况。