男性生殖器畸形对夫妻生活有较大影响，阴茎畸形可能会导致进入阴道困难，不能正常完成性交。
睾丸缺失畸形会影响性激素分泌、精子正常生成，从而就会出现阳痿而无法进行性生活；无精子生成会导致男性不育。精囊、输精管缺失、畸形会导致射精障碍，严重影响性愉悦感受以及导致不育。
为了最大限度恢复性功能以及促使精子正常生成，需要就诊后检查外观，彩超、造影等了解畸形严重程度，综合评估后根据情况可以药物维持治疗或者是手术矫形处理，最大限度提高夫妻生活质量以及生育力能力。